Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Scn3aA2ASI5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms