Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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