Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms