Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm2A2A7B5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms