Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd1Q9Z2E2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd1Q9Z2E2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd1Q9Z2E2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd1Q9Z2E2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Mbd1Q9Z2E2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mbd1Q9Z2E2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mbd1Q9Z2E2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mbd1Q9Z2E2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms