Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms