Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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