Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Kcnip3Q9QXT8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Kcnip3Q9QXT8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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