Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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