Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trim44Q9QXA7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trim44Q9QXA7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trim44Q9QXA7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms