Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms