Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms