Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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