Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms