Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b2Q9D9N2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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