Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms