Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms