Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Mrpl53Q9D1H8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Mrpl53Q9D1H8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Mrpl53Q9D1H8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms