Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms