Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d3Q9CSV6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms