Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms