Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms