Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms