Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Use1Q9CQ56 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Use1Q9CQ56 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Use1Q9CQ56 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Use1Q9CQ56 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Use1Q9CQ56 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Use1Q9CQ56 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Use1Q9CQ56 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Use1Q9CQ56 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Use1Q9CQ56 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Use1Q9CQ56 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Use1Q9CQ56 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Use1Q9CQ56 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Use1Q9CQ56 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Use1Q9CQ56 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Use1Q9CQ56 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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