Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms