Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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