Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms