Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Hps4Q99KG7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Hps4Q99KG7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hps4Q99KG7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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