Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TrabdQ99JY4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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