Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pacsin3Q99JB8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pacsin3Q99JB8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pacsin3Q99JB8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pacsin3Q99JB8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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