Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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