Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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