Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmco4Q91WU4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmco4Q91WU4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmco4Q91WU4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmco4Q91WU4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmco4Q91WU4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmco4Q91WU4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmco4Q91WU4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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