Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms