Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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