Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms