Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms