Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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