Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Nhlrc3Q8CCH2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Nhlrc3Q8CCH2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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