Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrp4bQ8C6J9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms