Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssc5dQ8BV57 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssc5dQ8BV57 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssc5dQ8BV57 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssc5dQ8BV57 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssc5dQ8BV57 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssc5dQ8BV57 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssc5dQ8BV57 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssc5dQ8BV57 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssc5dQ8BV57 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms