Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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