Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms