Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prune1Q8BIW1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prune1Q8BIW1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prune1Q8BIW1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prune1Q8BIW1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prune1Q8BIW1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prune1Q8BIW1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prune1Q8BIW1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune1Q8BIW1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms