Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp4f39Q8BGU0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms