Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms