Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms