Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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