Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms