Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms